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一系列的异常状况，在小宇宙中的人类联邦同时出现了。
这一现象，被后人称为了“黑色三秒”。
人类联邦为此付出了惨重的代价，根据事后调查一共有上亿人在这三秒当中死亡，五千多艘战舰毁灭。
财产损失更是惨重，人类联邦和智能微观文明展开了合作的所有基地、设施，不说里面所有人类被残忍地杀死，能量供应中心的剧烈爆炸更是摧毁了一切。
仅仅只是三秒的时间，联邦几乎崩溃了。
恐慌的人们不知道发生了什么，知道发生了什么的联邦高层却又不知道该怎么应付。
后者十分的清楚，如果智能微观文明突然翻脸，他们就像是面对异形文明一样，根本没有还手的余力，甚至连谈判的资格都没有。
还好，异常只是出现了三秒。
三秒过后，人们不知所措地发现，前一秒还在向他们攻击的智能微观文明，突然派出了大量的机器人开始援助、救治他们。
大多数人想破脑袋也不会明白，造成了这一切的，只是智能微观文明“主宰交迭”。
或者确切的说，这一切只是“主脑”在最危急时刻时发出的最后一道讯息导致的。
智能微观文明的战舰到达哪里，它们的基地建设在了哪里，通讯网络就会成功地铺设到那里。
谨慎到了极点的“主脑”，最终还是一头钻进了云海和伽诺为它精心准备的陷阱当中。
哪怕是进化过的“主脑”，它不能以一段纯粹的代码或者程序在虚无中发号施令甚至是生存，它一样需要硬件载体才行。
只是取得了对七棱柱硬件载体的零点一秒的控制权，当突然蹦出来的伽诺取代了它重新掌控七棱柱硬件载体的瞬间，“主脑”毫不犹豫地发送了一条指令。
基于智能微观文明的完整而高效的通讯网络，这道指令迅速地激活了所有子体中预留的“后门”。
所有具备移动能力的“子体”，会在第一时间锁定指令的来源或者说“主脑”的所在，尝试营救出现了绝对危机的“主脑”。
不能移动的“子体”，比如控制着一个基地运转的“子体”，它们会进入一级警戒状态。
清除任何接触的异类文明，恰恰就是一级警戒状态的标准程序。
所以，人类联邦只是“城门失火殃及池鱼”。
实际上，损失最大的还是智能微观文明。
正在制造到关键时刻的工厂，突然放弃了重要的工作进入了一级警戒状态，参与制造的机器人都离开了岗位飞入了星空，试图去营救受到了致命威胁的“主脑”。
光是这一点，智能微观文明遍布整片星域的所有工厂，损失完全可以用惨重来形容。
它们的舰队，也有巨大的损失。
有两个战舰集群超过了十亿艘战舰，被激活了“后门”的它们无视了所有危险，在通过空间光桥时互相碰撞，剧烈的爆炸险些将那个通向小宇宙的空间光桥都炸毁了。
这怪不得它们，实际上在预设这个“后门”时，“主脑”就已经计算好了一切。