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方原放走了岛津光久，还有不足十个亲信的倭兵，余下的倭兵全当作苦役去清扫战场。
如今方原已彻底掌控了战局的主动，开始清点战果，论功行赏。
施琅先交出了水师的捷报，被俘虏的郑军统帅林习山，十余个郑军千户，还有看押在舟山海军基地的一万余郑军。他的叔叔施福，他是想再劝降归顺，并不在献俘的名单之内。
这次施琅是立下了大功，再多的奖励也不足以褒奖他的功劳，方原将他提升成玄甲军副统领，与赤古台的地位并列，相当于副总兵的职位。
至于施福，还有林习山等人的处治，方原全权委托给了施琅处治。若是施福愿归降，可以用林习山，还有一万郑家水师的性命，去换回在福建的施家上千口族人，以免再遭郑芝龙屠杀。
方原对施家族人的保护，令施琅是感激涕零，急着回了舟山基地，再派人去和郑家谈判，交换俘虏之事。
景杰也报上了陆战的清点结果，今次玄甲军伤亡九千二百人，其中步战营损失最为惨重，达六千一百人；骑兵营损失二千人；水师营损失一千一百人，消耗的粮食、军备、战马、火炮、硝石等折合银子二十三万两。
而敌方伤亡总数在七万五千人，被俘虏一万二千人。其中郑家陆军损失三万七千人，俘虏一万二千人，连最精锐的五千虎贲近卫也损失了四千，几乎被打残；郑家水师损失战舰二百二十艘，战死四千八百人；倭兵损失三万七千人，俘虏三千人。
玄甲军一共缴获了郑军水师的军粮两万石，金银二千两，火炮八十门，倭刀三万一千把，倭式的鸟枪八千支。
双方战损比达到了1：8左右，玄甲军虽损失不小，但打出这么大的战损比，确实是一场了不起的胜仗。
景杰汇报了战果后，负责锦衣卫的秦展又汇报说，“老大，这次大战期间，辖内除了被入侵的苏州府、松江府，引起了当地百姓的恐慌，并无一起大规模的聚众闹事事件。”
方原问道，“那帮官员呢？文人呢？顾炎武的那个光明报呢？”
秦展如实的说道，“那帮官员是各司其职，没有任何异动，常州、镇江的王秉鉴还亲自召集民夫支援京口码头的战事；苏州府的陈洪谧也在召集苏州府百姓前去太仓州支援抵抗倭兵入侵。”
“文人嘛！谈的最多就是在苏州、松江二府被入侵时，指责方总督根本不会打仗瞎指挥，要换他们来，直接放上几炮，骑兵一冲，倭兵就没了。”
方原忍俊不禁的笑了笑，这些酸文人喜欢自恃清高，自以为是的打嘴炮全在他的预料之中，但他们谈论的是怎么抵抗外敌，而不是如同浙江一样希望引狼入室，充分证明了如今的五府，无论官员，还是民间都安心的认可了方原的统治。
方原欣慰的一笑，支拨了秦展，锦衣卫五千两银子，算是奖赏。
秦展汇报后，麻林又前来请罪，等候方原的责罚。
麻林丢失了镇海、金山二卫，但在湖州府以区区两千人拖住了郑森的四万大军，更取得了湖州大捷，可以说是功过相抵，方原也就稍作训诫后，令他继续担任步战营统领。
方原还交给麻林一个任务，就是由水师营配合，派人前去河南、湖广等人招募流离失所的精壮流民、年轻女子十万人回来安置，用于充实损失惨重的步战营，还有给玄甲军士分派配偶。
他还支拨给了麻林五万两银子用作这次流民招募、安置的费用。
方原逐一论功行赏后，景杰站了出来开始请战出兵浙江，“老大，郑家现在已遭受重创，再无一战之力，我军该趁胜出击，将郑军彻底赶出浙江。”
众将是群情激奋，纷纷出来请战，要将郑军赶尽杀绝。