刘进忠得到报告，四军主将椿树湾中了明军的计策伤亡惨重，大败而回，大批的明军已经杀到城下。
刘进忠大惊，战场上真是瞬息万变，刚才不是大西军攻进了明军的大营，明军被杀得大败，怎么转眼之间就有如此惨败？
很快，刘进忠明白了。李自成制造了兵变，鸡鸣山上劫粮肯定不会成功。想让明军首尾难顾已经成为奢望，椿树湾的明军大营本来就是朱由崧故意露出的破绽，在这种情况下四军主将不败等什么呢？
刘进忠不敢再追杀李自成了，现在他调动的人马全都是守城的兵将。
按照张献忠事前的分工，刘进忠的主要任务是守住夔州城，保护皇宫，现在皇宫出了这么大的事，张献忠还没找他算账，如果夔州再丢了，张献忠非刨他的祖坟不可。
负责镇守夔州的大西军共有5万，除去守把皇宫的一万军队，实际上城防力量只有4万人，李自成制造了夔州兵变杀进了皇宫，刘进忠又紧急抽调了两万多人马，这样算来现在守城的人马不足两万人，这么大的夔州城一万多人如何守得住？
而且现在更要命的是，四军主将带着残兵败将大败而回，明军紧追不舍，尾随而至，明军士气正盛，大西军军心涣散。
还有北城门现在尚未夺回，李自成这几千人马也不是好对付的，虽然他们只有4000人左右，李自成悍猛，李过，高一功，袁宗第，刘芳亮，田见秀，皆是万人敌。
因此刘进忠权衡利弊之后，决定不再追击李自成了，必须得纠集人马守住夔州城。
因此刘进忠指挥着人马打算上城守城。
现在四军主将带回来的人马也不知道有多少，在椿树湾明军大营，前军主将王定国遇到了马金花，王定国挨了一枪，已经死在乱军之中。现在四军主将逃回夔州城的只有中军主将王尚礼，左军主将马元利和右军主将张化龙。
等这三员主将纠集残部在刘进忠的人马屁股后面准备上城守城的时候，已经晚了。
李柱石的炮营压制住城头城的火力之后，守城的人马来来回回，增增减减，军心早已浮动，有的指挥混乱，一会儿东一会儿西，弄得这些守城的兵将晕头转向，不知道该听谁的，不少军将骂骂咧咧挤在一起，还没到指定的地点便被炸得稀烂，有的干脆趁着混乱逃命了。
因此李柱石的炮营停止攻击之后，大批的明军一鼓作气便攻上城头。
大西军刚刚在椿树湾吃了败仗，也不知道又明军又冲上来多少，因为这是黑天，到处是火把，喊杀声震天动地，大西军军心大散，兵无斗志，这些残兵败将很大一部分是在逃命，因此明军很快攻入城中。
从明军开始攻城到大批的军队攻入城中，只用了一顿饭的时间。这可以说是朱由崧的军队攻城最快的一次，称得上是闪电战，对固若金汤的夔州城，简直是一种讽刺。
此时城中的大西军队并不少，如果数一数，应该不会少于10万，但是再多的人马军心浮动，指挥不灵也形不成战力，这就像是人没了精神，军队没有了军魂，只能干吃败仗，任人宰割。