石门桥阻击战整整进行了一个白天，当晚的二更时分，歼灭战便打响了。
朱由崧所料不差，来的正是宋献策所率领的明军主力。
别看这支明军的主力现在只有不足8万人，但是歼灭20多万大军已经绰绰有余了。
当初凤凰山下的明军大营，不算五万水师营共有十三万人马。朱由崧拉出五万，东拒李定国之后，折向西南诈开城门，闪电般拿下了大西京师成都，然后出奇兵在石门桥镇修筑工事，阻断大西军回防成都，最终目的是为了把大西军拖一圈，拖得疲惫不堪，然后与宋献策的主力在这一带歼灭大西军的主力。
虽然阻击战打的代价有点大，但是这一战略目的达到了，一切都是按照朱有松的计划进行，这个计划就是朱松当初定下的，灭亡大西的分布推进计划。
宋献策率领近8万大军，向东撤退。以溃退的假象引得二十五万大西军，水陆并进，围追堵截，局部的小战争也是有的，断后的战斗加上抢夺阵地的战斗，这期间明军也损失了几千人马。
但是这一天，大西军便知道大祸临头了。
京城丢了，20多万大西军成了丧家之犬惶惶不可终日，不只是高级将领，一些中层将领、基层将领乃至一些普通将士，他们很多人的家都在京城一带，现在京师被朱由崧端了，家没了，后院起火，他们只盼赶紧回师，连夜急行军，夺回京师，保护他们的家小。
因此这20多万大西军被朱由崧阻击在石门桥镇一带时，全都是疲惫之师，只有精神在支撑着他们。张献忠的权威圣旨相对来说对他们则是次要的。
然而朱由崧一天的阻击战又把他们打垮了，这个时候宋献策带领准确的数是七万明军突然出现在其后方，20多万大军彻底崩溃了。
宋献策这七万大军该睡睡，该吃吃，该跑跑。先是撤退，后是追击，这两天把大西军拖得精疲力尽，相对这些大西军来说，宋献策他们精力比较充沛。
他们接到朱由崧的旨意，转入反攻，追击大西军。
这两只军队遭遇，一个是疲惫不堪，一个是精力充沛，一个是溃散之师，一个是追敌之军，因此双方这一对比，胜负立分。
别看数量上，大西军占用绝对优势。但是他们败局已定，军心大散。兵无斗志，指挥失灵，四散奔逃。逃不了的，被斩杀在当场，有的集团体缴械投降。
一场几乎是一边倒的大战，从是夜二更过后一直持续到天亮。
最后孙可望和王尚礼带着残兵败将，终于杀出重围，后来黔国公沐天波带着滇军也跟了上来。
三员主将，兵合一处。看看后面明军没有追来，他们停下来喘息，白天急行军，晚上打了一宿，铁打的人估计也受不了，包括主将在内存都累坏了。
查点人数，三员主将合在一块一共25万人马，经过这不到两天的时间，现在连零头都没剩下，加上沐天波的滇军，只有三万七千多人。
再看这3万多残兵败将，从将领到兵卒，一个个焦头烂额，甲衣不整，有的头盔和战靴都丢了，那张脸黑乌蓝青，跟从灶坑里钻出来差不多。
这一仗败的太惨了。三员主将从来没有吃过这样的败仗，尤其平东王是孙可望，更是第一次遭遇如此的惨败。
他觉得无颜面回去见张献忠交代，拔出腰中的宝剑要自杀，被亲兵劝住，王尚礼夺下了他的宝剑。
冷静下来，三员主将商议之后，带着残兵败将，回凤凰山，向张献忠交旨请罪去了。
石门桥大捷，明军以多胜少，取得了重大胜利，朱由崧带着李全和几名锦衣卫与宋献策的人马胜利会师。
这一天与他离开凤凰山大营，满打满算，只有一个月零八天。短短的不足40天时间，朱由崧活捉了李定国，智取了大西京师，成功阻击了20多万大西军，最后打了一个漂亮的歼灭战。